O IZMA está situado em uma vasta área de Mata Atlântica, onde são encontradas várias espécies de animais e plantas.

Estudos vêm sendo realizados, com o objetivo de levantar as espécies (biodiversidade) e com isso preservar melhor este bioma sensível e em risco de extinção.

Mata Atlântica

A região caracteriza-se pelo clima tropical de altitude, com temperatura média de 21°C e pluviosidade média de 1200 mm anuais. O relevo é de ondulado a fortemente ondulado com média de altitude cerca de 700m. Os tipos de solos predominantes são o podizólico amarelo, vermelho amarelo e latossolo nas áreas de baixada. Sua cobertura vegetal, originalmente de Floresta Pluvial Atlântica, encontra-se reduzida a fragmentos de mata secundária tendo como espécies representativas, Schizolobium parahyba, Piptadenia gonoacantha, Euterpe edulis, Cupania oblongifolia, Atallea dubia e Apuleia leiocarpa.
O fragmento de maior importância ecológica é o compreendido pela Serra do Pau Ferro onde o IZMA está inserido.